Bogactwo fauny i flory, ciekawa rzeźba terenu i czyste jeziora sprawiają, że Gmina Miłakowo należy do jednych z najciekawszych i najpiękniejszych miejsc w naszym kraju.
W Sąglewie niedaleko Dworu w Bieniaszach znajduje się hodowla danieli.
Ciekawostką przyrodniczą jest położona w pobliżu miasta łąka, na której rosną obok siebie cztery gatunki storczyków.
Gmina Miłakowo ma najwięcej pomników przyrody w Polsce, jest tu ponad 500 drzew pomnikowych. Rośnie tu również dąb liczący około 900 lat, nazwany przez swojego odkrywcę „Batiuszka”.
Rezerwat „Ostoja Bobrów na rzece Pasłęce”- rezerwat faunistyczny o łącznej powierzchni 4258,79 ha, utworzony w 1970 roku w celu zachowania stanowisk bobra. Na terenie gminy Miłakowo zajmuje obszar 285 ha.